Trinità d’Agultu è un centro relativamente recente nella storia sarda, nato nel XIX secolo come frazione agricola e pastorale, poi divenuto comune autonomo nel 1959.

Il nome "Trinità" deriva da una piccola chiesa campestre dedicata alla Santissima Trinità, che rappresenta tutt’oggi un luogo simbolico per la comunità. “Agultu”, invece, è un toponimo arcaico legato a un antico insediamento agro-pastorale, testimone della presenza umana in questa zona ben prima della fondazione amministrativa del paese.

Fino al XIX secolo, quest’area era scarsamente urbanizzata e caratterizzata da un'economia rurale basata sull’agricoltura e soprattutto sulla pastorizia. Il territorio era organizzato secondo il modello dello stazzo gallurese, l’antica unità abitativa e produttiva tipica della Gallura: una casa in pietra isolata, con annessi ricoveri per animali, orto e spazi comunitari. Questi stazzi non erano solo centri economici, ma veri nuclei familiari che hanno contribuito alla formazione dell’identità culturale e linguistica del luogo.

I primi insediamenti veri e propri iniziarono a consolidarsi solo tra la fine dell’Ottocento e l’inizio del Novecento, attorno alla chiesa della Santissima Trinità, da cui il paese prenderà il nome. Il culto cristiano, portato avanti nelle piccole chiese rurali, divenne un punto di riferimento simbolico per le comunità disperse negli stazzi.

Il toponimo Agultu ha origini più antiche e misteriose. Potrebbe derivare da una parola prelatina o da un termine legato al paesaggio (“collina”, “altura” o “pascolo”), ma la sua etimologia resta incerta. Quel che è certo è che la zona di Agultu fu abitata e conosciuta molto prima della nascita del borgo attuale.

Nel secondo dopoguerra, grazie al miglioramento delle comunicazioni stradali e all’incremento delle attività agricole e forestali, il nucleo abitato crebbe rapidamente. Questo sviluppo portò alla richiesta di autonomia amministrativa da Tempio Pausania, ottenuta ufficialmente con la Legge Regionale del 1959 che sancì la nascita del nuovo Comune.

Nel corso degli anni successivi, anche la località costiera di Vignola Mare si è sviluppata, inizialmente come piccolo insediamento marittimo e oggi divenuta una delle mete turistiche più apprezzate della zona.